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CTO访谈之仁东医学赵国栋宽度1cm深度1km肿瘤免疫也要重度垂直

时间:2019-09-05 12:22:31  阅读:7778+ 作者:动脉网

原标题:CTO访谈之仁东医学赵国栋:宽度1cm、深度1km,肿瘤免疫也要重度笔直

赵国栋第一次接触到NGS技能,是在2006年。那个时候Illumina还没有收买solex,PD-1的临床价值百科还没有得到验证,本钱的约束,让NGS可以商场化看起来十分悠远。

2012年,NGS本钱开端敏捷下降,业界开端有人测验将NGS技能运用到肿瘤基因检测范畴。“瑞金医院、中山医院等一批大医院在做,其时国内成型的公司很少,国外Foundation Medicine这样的公司也刚刚起步。”赵国栋回想道。比较传统的免疫确诊和病理确诊,人们对NGS还知之甚少,正在赛默飞的赵国栋基本是国内第一批研制人员。

这一段时刻也被称为NGS商业化的沉淀期,精准医疗概念在此阶段被初度提出,无论是疾病的确诊仍是医治,都开端从普适化向个性化开展。检测更多基因,做个性化医治成为疾病医治的大趋势。

相同也是在2012年,BMS第一次发布了PD-1的试验数据,引起业界轰动。在这之前,PD-1更像是一个传说,没人知道好不好。至此之后,BMS、默沙东、辉瑞、罗氏、阿斯利康、礼来等巨子敏捷涌入,国内君实、信达、恒瑞等企业也开端布局。相关的药物在几年后陆连续续上市,肿瘤医治迎来一场推翻。

“很少有靶点能像PD-1这样,有上百家药企涌入其间。“仁东医学CEO金鸽曾在一次采访中泄漏。赵国栋在仁东医学树立之初作为开创合伙人,担任CTO。

因为前期与一家进入免疫药物的药企联络严密,在医学研讨做了许多研讨之后,仁东医学承认了肿瘤免疫这个方向。几年后,肿瘤免疫医治的确诊范畴,成了基因检测企业的兵家必争之地。

2016年头,赵国栋观赏美国Human Longevity公司

专心,All in 肿瘤免疫

经过了几十年的开展,肿瘤免疫医治在近十年取得了巨大的成功。跟着以PD-1等抗体为代表的免疫检查点抑制剂在临床上的广泛引证,肿瘤免疫医治的开展更是进入了快车道。

“生物药的医治计划跟靶向药的距离挺大的。”问及对肿瘤免疫医治开端的形象时,赵国栋这样标明。靶向医治一般只需求验证几个相关基因是否有特定的骤变,但肿瘤免疫还跟整个肿瘤和免疫细胞的骤变与状况有关。“维度更广,咱们的医学团队做了许多研讨。”他弥补道。从RNA层面去调查免疫通路状况,寻觅更多的位点和符号物,单一目标和多维度目标的行列研讨……他们正在经过各式各样的方法更精确探知怎样对患者进行愈加精准的分层。

毋庸置疑的是,比较分子靶向医治,肿瘤免疫医治更具普适性,这是一个具有巨大临床价值百科的疗法,国内外的许多药企都争相涌入。但现在免疫医治商场仍面临诸多困难,其间一点便是药物的应对率较低。

“肿瘤患者的客观缓解率(ORR)一般只要20%左右,一部分患者也或许会在医治的进程中有免疫耐药以及超发展(HP)现象。”赵国栋向动脉网解说。怎样从分子检测层面临初度承受医治的患者做出更有用的分层,是现在肿瘤随同确诊公司正在努力处理的问题。

在此方面,除了惯例的TMB、MSI、dMMR、Pros/Cons IO、PD-L1、CD8+等信息外,仁东医学还加入了GEP、clonal TMB、indel TMB等愈加杂乱的目标,涵盖了肿瘤微环境以及肿瘤骤变图谱等相关目标。研讨人员期望经过研讨每一个目标与免疫医医治效的联络,然后承认单一目标对免疫医治的分层效能。

针对单个目标猜测效能的缺少,研制团队又树立了相对愈加深化的多维度目标猜测模型。比较前者,多维度目标杂乱程度更高。但经过生信团队算法的打破,现在仁东医学全体均匀的PPV(Predicted Positive Value)和AUC(Area Under the Curve)都可以到达90%以上。

另一方面,免疫医治和其他医治方法比较,其收效时刻也比较慢。免疫细胞滋润之后会让疾病发展确诊面临假性发展,难以辨别。经过什么样的检测计划判定医治进程中的假性发展也是随同确诊公司可以浸透的事务方向之一。

赵国栋向动脉网泄漏,仁东医学总共挑选了四个层面临免疫医治的作用进行监控,包括fragment size、TMB、drive mutation、tumor fraction。他告知动脉网,免疫激活需求时刻,即使前期做了患者分层,免疫医治显示出医治作用的时刻比靶向药物要长。在这个进程中,有些患者可以获益,有些患者耐药,乃至还有患者或许呈现爆发性发展。这些多层面的监控手法其实是为了更早的发现免疫耐药状况,以及判定假性发展,让患者可以更早的挑选适宜的医治计划。

环绕患者分层和监测,仁东医学为患者供给“诊”这一阶段的全流程服务。PD-1应对率低是药物研制层面,作为检测服务公司,他们很难直接去处理这一难题。但数据是有价值百科的,根据多年来在肿瘤免疫范畴的堆集,这家公司也期望可以运用手中数据的力气去发掘临床更深一层的需求。

为此,仁东医学在2017年发起了万人肿瘤免疫方舟计划,旨在协助医师和专家树立实在国际的肿瘤数据库,完成数据实在的价值百科。据了解,现在方舟计划现已堆集了超越1000例全数据样本,包括临床表型数据、组学数据以及临床免疫药物作用数据。

2017年10月,仁东医学在北京举办发布会,“万人肿瘤免疫方舟计划”正式发动

“neoantigen以及common neoantigen的研制主要是和第三方公司进行协作。”赵国栋向动脉网泄漏,为了给肿瘤患者树立全流程的肿瘤医治闭环,仁东医学也触及了肿瘤疫苗医治事务。“从小鼠PoC试验来看,全体的医治作用还不错。”他持续说道。经过新抗原猜测进行多肽和mRNA疫苗规划,小鼠PoC试验标明整个体系作用很好。他期望经过个性化的免疫联合医治来针对性医治对PD-1抗体不灵敏的人群。

2019年NGS开发者大会,赵国栋向咱们共享“GSA-Pipe在肿瘤免疫医治和疫苗医治的运用”

研制人数占总人数一半

以上布局的中心其实是环绕免疫医治的现状和临床痛点,其全面体系的分子检测,以及独有的S-type、UMT技能以及GSA-pipe剖析体系为产品的研制供给了很大的支撑。在技能渠道的加持下,研制团队得以捕捉到更精准、更全面的肿瘤和免疫信息,然后愈加高效的协助临床作出正确有用的医治决议计划。

但相同值得一提的是,医学团队的力气也不容小觑。

在仁东医学挨近90人的研制团队中,有一只40人规划的医学小分队。经过这一个团队,仁东医学得以在产品的规划上愈加靠近临床和实际的需求,在医学团队对临床痛点进行调研和发掘后,仁东医学在产品研制进程中有了更多临床决议计划相关的考量,为临床医师和终端患者供给更多的协助。

“整个团队的特征都跟公司的战略严密结合,仁东医学是在细分癌种里边去做拓宽,每一个患者都会做深度的检测和临床解读。”赵国栋标明。再加上生信团队在算法上的深耕,经过对剖析途径的打磨完成个性化的产品规划。“产品规划的思路是临床的需求和运用,高的灵敏度和特异性是处理这些问题和需求的条件。”他弥补道。

医学、试验、生信和算法团队,整个研制部队人数占了公司总人数的一半。研制部门一般会依照不同的分工将人手分红几条线,临床有哪些医治痛点、有哪些医治途径、哪些地方需求检测,不同的途径上会有专门的团队去深度发掘。赵国栋把这称之为三位一体的临床转化开发。

深耕泌尿体系肿瘤

除了深耕肿瘤免疫商场,仁东医学对泌尿系肿瘤的研讨也颇有建树。他们是国内最早一批专心泌尿系肿瘤的检测公司。“泌尿外科的许多癌种都缺少医治辅导计划,大部分临床用药都是经历用药。如果能经过分子检测对患者进行分层,这对患者来说十分有含义。”谈及为何要挑选泌尿肿瘤,赵国栋这样解说。

据悉,仁东医学医学已在泌尿肿瘤里推出三大产品系列,前腺安TM、优可安TM、肾世安TM,别离针对前列腺癌、尿路上皮癌以及肾癌的预后、用药、复发发展监测及遗传危险评价等全周期办理辅导。差异于其他NGS公司,咱们在每一个癌种里都有特征系列产品,贴合临床医治途径,辅佐临床医治决议计划。

现在仁东医学正在树立全国最大的前列腺癌数据库,包括体细胞图谱、肿瘤不同阶段图谱,以及患者用药和医治等数据。“里边包括了随访数据和检测数据,这对药物研制和临床循证来说含义特殊。”赵国栋向动脉网介绍,“这是一个大工程,咱们花了一年的时刻去整合。”

该项目于2017年正式立项,两年半的时刻内团队现已树立了3500人以上的行列研讨数据。

做医治一体化服务

肿瘤免疫药物连续在国内上市后,大大小小的肿瘤检测公司都开端往免疫医治随同确诊方向布局。一时刻,免疫医治随同确诊也开端呈现同质化竞赛。但因为进场较早、满足专心,仁东医学仍然在同质化竞赛中打出了差异化。

技能渠道的优势、产品的丰厚维度、以及巨大的数据堆集和深度发掘为仁东医学构建起了职业护城河,并深得业界头部专家的信赖与认可。“这是咱们的优势。”赵国栋这样标明。

但他也着重,仁东医学并非一家单一的基因检测公司,他们期望能为患者供给的,是肿瘤医治一体化的服务。

“检测是一部分。”赵国栋解说说。根据对临床和随访数据的发掘,以及肿瘤的行列研讨,仁东医学期望这些数据的价值百科不仅仅是体现在患者的医治上,已与多家药企协作,运用这些数据协助药企进行药物临床研制、协助临床试验挑选患者入组,期望实在国际的研讨可以愈加实在的呈现药物价值百科、提醒疾病发作与医治的奥妙。

数据成为了这一切的源动力,根据这个逻辑,仁东医学努力于赋能肿瘤医治的整个流程,提高临床对肿瘤医治的全体才能。

“咱们的中心是辅佐专家做临床决议计划和确诊,供给更多信息。”他告知动脉网,仁东医学在近年与专家达成了十分多的协作,也堆集了相当大的数据资源,他期望这些数据可以终究回到临床进行服务,并协助药企进行药物开发。

写在最终

在不到一个小时的攀谈中,很明显的感触是赵国栋并不是传统的科研人员,而是一位根据根底科研去做转化研讨的研制者。这一点让仁东医学全体研制团队独具特征,环绕临床需求,他们运用多元化的团队树立起了根底研讨与临床产品之间的转化桥梁,可以精确的掌握临床需求与产品开发的每一个细节。

集合全方位的人才,专心一件工作,把工作做到极致,这是仁东医学留给咱们最深的形象。

*封面图片由受访者供给。

文 | 周梦亚

微信 | rencontre_my

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